光纖激光切割機光波長對眼睛有害，所以使用前必須要護眼，也要采取一定的護眼措施。由於相關的技術出現時間不足5年，所以在使用前建議先進行適當的相關係統操作

很多的操作人員都沒有相關的光纖激光切割的切割經驗，更應該通過對光纖切割係統進行係列的初始培訓來彌補相關的經驗不足。切割用的材料是需要注意的重要一項。光纖激光切割雖然善於切割大部分材料，但是目前還不能用於切割丙烯酸類或聚碳酸酯類材料，暫時僅能切割有限應用領域中的木質或纖維材料。要切割材料的厚度是一項很重要的因素。較厚的材料需要更大的功率切割，而這些情況下，激光切割可能並非是很好的選擇。